История Башкирского центра ОВД ведет свой отсчет с момента образования самостоятельного предприятия — ГУП «Башаэронавигация», которое было создано на базе службы управления воздушным движением (УВД) и службы по эксплуатации радиотехнического оборудования и связи (ЭРТОС), выделенных из состава авиакомпании «Башкирские авиалинии» в июле 1999 года.

В настоящее время Башкирский центр ОВД осуществляет аэронавигационное обслуживание воздушных судов Российских и зарубежных авиакомпаний при полетах в небе Башкортостана. В воздушном пространстве над территорией республики проходят внутренние и международные воздушные трассы. Общая протяженность обслуживаемых воздушных трасс — 4 963 км., по местным воздушных линиям — 8 864 км. Площадь обслуживаемого воздушного пространства — 101 736 кв. км.

Число обслуженных воздушных судов в первом полугодии 2008 года составило 88668, что на 18% больше, чем за аналогичный период 2007 года.

Трудовой коллектив Башкирского центра ОВД составляют около 400 человек различных специальностей. В службах ведется регулярная профессиональная подготовка диспетчерского и технического состава, 85% диспетчеров обеспечивают УВД на английском языке.